تبذل حديقة الحيوانات بالعين جهوداَ حثيثة ومستمرة في تعزيز الغطاء النباتي وتجميل المساحات الواسعة الخضراء ضمن دورها في الحفاظ على الحياة البرية وصون الطبيعة من خلال مشاريعها التحسينية والتطويرية وأعمال الصيانة الوقائية التي يقف خلفها فريق قسم البستنة.
وبغرض توفير الظل وتحسين المنظر العام تمت زراعة مجموعة من النباتات المحلية والتي تتميز بقلة استهلاكها للمياه ومقاومتها للحرارة والجفاف مثل أشجار السدر والغاف و الغضف والحناء والراك وكف مريم والعسبج والنباتات غير المحلية مثل الروليا والسنسفيريا وصباح الخير والشاي الأزرق وغيرها.

وتم استخدام مغطيات التربة الطبيعية مثل نشارة الخشب والأحجار لأعمال التنسيق في الحديقة بهدف إضفاء منظر جمالي والتقليل من استهلاك مياه الري بالإضافة إلى التقليل من مساحات العشب غير الضرورية .  
يعمل فريق البستنة على تقنين استخدام نظام الري في عدة أماكن في الحديقة بغرض التقليل من عمليات الصيانة الخاصة بإزالة الأعشاب الضارة وتحسين المنظر العام للمناطق وتطبيق الاستفادة المثلى لنظام الري وتجنب انجراف التربة، فضلاَ عن وضع حواجز طبيعية من المواد المعاد تدويرها لأغراض الأمن والسلامة ولتحقيق أهداف الاستدامة التي تسعى الحديقة لتطبيقها.